Как правильно прописать, что материнский капитал идет в счет первоначального взноса?

Добрый день.

Вам в договоре вообще ничего про материнский капитал писать не нужно.

Материнский капитал в качестве первоначального взноса просто учитывает банк, при расчете размера выдаваемого Вам кредита.

После того как вы заключите договор купли-продажи и зарегистрируете право собственности Вы уже пойдете в Пенсионный фонд и напишите заявление о распоряжении средствами материнского капитала на погашение ипотеки. Пенсионный фонд рассмотрит заявление и перечислит деньги банку в погашении части ипотечного кредита.

Удачи